DNA什么样的峰是杂峰对于两端都是杂峰的序列,我要人工删除后blast比对,从什么地方开始删呢?什么样的峰是杂峰?
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/06/25 16:09:36
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DNA什么样的峰是杂峰
对于两端都是杂峰的序列,我要人工删除后blast比对,从什么地方开始删呢?什么样的峰是杂峰?
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测序公司返回给你有两个文件,一个是文本序列,一个是测序的信号文件.
打开信号文件,强信号也就是所谓的峰,一个峰代表一种碱基,如果某一处不止一个强信号,或者说峰之间相互重叠甚至连绵成一片乃至看不出峰,就说明就是杂峰或者信号干扰严重.一般是测序前20bp以及最后几百bp是这样,这和测序公司的技术水平有关.
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看上面的图中这样一个一个峰很明显的才是有效的序列部分,其余的序列都是无效的.要删除.